THE SURVIVAL OF THE FITTEST: LEVEN MET KIWI'S EN CRISPRS



Op 4 maart 2014 vertrek ik voor twee jaar naar Nieuw Zeeland. Dunedin is de place to be. Ik ga er werken aan de University of Otago, de oudste universiteit van Nieuw Zeeland. Dunedin ligt op het Zuidereiland, zo'n 400 kilometer onder Christchurch. Het heeft een gematigd zeeklimaat. Net als Nederland.

maandag 14 april 2014

RAYMOND MET ZIJN KOP IN DE OTAGO DAILY NEWS, MAAR ZONDER ZIJN PEUKENPOT

Amper een maand in Nieuw Zeeland, of meneer staat op 10 april jl. al met zijn kop in de Otago Daily News.  Het bewuste artikel staat aan het einde van dit bericht. Om met zijn kop in de krant te komen zal hij wel een jonge, blonde PR-dame gestrikt hebben. Hoewel hij dat tot nu toe angstvallig geheim heeft weten te houden. 

Vanmorgen onverwacht weer even geskypt met Raymond. Half tien 's avonds in Dunedin. Het tijdsverschil bedraagt sinds een week 10 uur: zomertijd in Nederland, wintertijd in Nieuw Zeeland. 
Raymond mailt dat hij een sigaret lang tijd heeft om te skypen. Daarna moet hij nog even aan het werk. Sigaretten zijn extreem duur in Nieuw Zeeland, maar blijkbaar levert het ontspanning op aan het einde van de dag. Daar staat hij. Nacht in Peter's Garden. Diep beneden de stadsverlichting van Dunedin. Donker, dus. Alleen het uiteinde van zijn brandende sigaret licht op in het donker.
Nuttig gesprek, want hij leert me in een paar minuten twee dingen: 1. hoe een screenshot te kopiëren in het blog, en 2. hoe een webpagina als platte tekst te plaatsen in het blog. In deze aflevering dus gelijk maar toegepast.



Ik plaats een paar screenshots van zijn peukenpot (ik geloof dat het een lege jampot is: bramen? aardbeien?). Hij moet er wel voor naar binnen lopen. De glazen pot zit na een maand paffen vol. Vraag: hoe moet hij de inhoud van de pot kwijt zien te worden of ongezien van de aardbodem laten verdwijnen? Zomaar leeg kieperen in de voortuin van collega Peter, ligt niet direct voor de hand. Misschien zijn er in zijn lab bacteriën op te kweken? Andere opties heeft hij nog niet overwogen. Ik wel: stoppen met roken.





De andere les probeer ik ook maar gelijk in de praktijk, en plaats daarom het krantenartikel van een paar dagen geleden. Zonder internet-opmaak, als platte tekst. Kijken of het lukt.
Hieronder het artikel van John Gibbs uit de Otago Daily Times van 10 april 2014:

SPOTLIGHT ON BACTERIAL IMMUNE SYSTEM 
Research involving University of Otago scientists has shed new light on a ''surprisingly flexible'' immune system which has enabled bacteria to survive a multibillion-year-long arms race with viruses.
A team co-led by Dr Peter Fineran, of the Otago department of microbiology and immunology, and by scientists from the Netherlands, have been studying the genetic basis of adaptive immunity in E. coli and other bacteria.
Through their recent collaboration, they have found these bacterial immune systems were much more robust and responsive to viruses than previously thought.
Their ''really exciting'' joint findings had appeared in the leading US journal PNAS, Dr Fineran said.


Assistant research fellow Raymond Staals (left) and Dr Peter Fineran, of the University of Otago microbiology and immunology department, continue their research. Photo by Gregor Richardson.
Better understanding the bacterial immune system could eventually help reduce the growth of bacterial resistance in individual patients and could identify new targets for antimicrobial therapies.
The researchers are investigating an adaptive immune system - termed CRISPR-Cas - which is found in half of all bacterial species and in most single-celled microbes in the archaea domain. The system creates a genetic memory of specific past infections by viruses and plasmids.

Plasmids are small DNA molecules that can move between organisms. Dr Fineran said the system stole samples of the invader's genetic material and stored them so it could recognise future exposures and neutralise the attack.

The Otago research showed this detection system could recognise a previously encountered ''invader'', even if later mutation meant the intruder was up to 30% different from before.

This was equivalent to a human being recognised on a security camera during a later visit to a building despite being disguised, such as by wearing sunglasses. It had previously been thought subsequent immune recognition could occur if there was only about a 3% change in appearance by the invader.

''It's a remarkably flexible and robust immune system for such simple single-celled organisms.''
This system reflected the 3.5 billion-year ''co-evolutionary arms race'' between bacteria on one side, and viruses and plasmids on the other, he said.
Dr Fineran's research was supported by a Rutherford Discovery Fellowship from the Royal Society of New Zealand.

1 opmerking:

  1. Jaaa, ziet er veel beter uit zo.... de onopgemaakte tekst dan, niet die peukenpot...... nog mijn kop :)

    Raymond

    BeantwoordenVerwijderen

reactie kan hier